Warhammer 40,000: Space Marine II a rencontré son premier obstacle avec le lancement de la mise à jour 4.0. Tout comme pour Helldivers II, où les armes les plus prisées avaient été affaiblies, les joueurs ont ressenti que Saber Interactive réduisait le plaisir de l'expérience PvE en rendant les armes moins efficaces et les ennemis plus puissants.
Cependant, dans le patch 4.1, le directeur du jeu Dmitry Grigorenko souligne que les développeurs ont écouté les commentaires, et qu'ils vont apporter des changements en fonction de ceux-ci. "Quels que soient les retours, nous sommes reconnaissants que vous vous sentiez si passionnés par Warhammer 40 000 : Space Marine 2", écrit Grigorenko.
Le patch modifie le taux de spawn et la force des ennemis Extremis dans toutes les difficultés, et il booste également les armes Bolter suivantes :
Espérons que ces changements feront du jeu un défi digne d'un Space Marine de haut niveau, sans pour autant le rendre désagréable à jouer. Suite à la controverse Helldivers II, les gens sont beaucoup moins enclins à accepter que leur jeu devienne soudainement plus difficile sans véritable raison.